若使用ELSD檢測器，首先開啟氮氣壓力到3.5bar，確保能持續供氣（如未配置ELSD檢測器，請忽略此步驟）。

打開泵、自動進樣器、柱溫箱和檢測器模塊的電源。

打開電腦，啟動Clarity工作站。

開排氣閥，單個通路排氣泡，排完后記得旋緊。

設置流動相初始比例開始平衡；若流動相含有緩沖鹽，請先用10%的有機相水溶液進行過渡，再換成儀器方法初始比例的流動相進行平衡。

執行自動進樣器清洗命令，并將進樣閥切換至Inject的狀態進行平衡。

設置柱溫箱溫度。

若使用VWD/DAD檢測器，待泵開啟約5min后再打開氘燈和/或鎢燈，并設置檢測波長等。

若使用FLD檢測器，需設置池溫、激發波長、發射波長、采集頻率等。

若使用RI檢測器：先打開沖洗閥（purge=on）沖洗參比池約20min，再關閉沖洗閥（purge=off），并設置池溫和極性。

監測基線，待系統流路充分平衡后，基線正常穩定，可以開始進樣分析。

餾分收集器內依次放入干凈的試管，試管個數滿足分析時所用個數。

流動相準備：配置所需的流動相，對配置好的流動相進行超聲、過濾、脫氣，后置于干凈的溶劑瓶，配備的量需足夠分析。

溶劑濾頭清洗，對新的溶劑濾頭需置于異丙醇中超聲30分鐘，去除雜質，使用過程中，也需定期對溶劑濾頭進行清洗。

進樣閥清洗，在'LOAD'模式下，以注射器將流動相注入進樣閥內清洗幾次，每次用量可為定量環體積的 2-3倍；后置于'INJECT'模式下，再用流動相清洗進樣閥，每次用量可為定量環體積的 2-3倍。

按順序打開儀器各模塊的電源→電腦電源→打開工作站。確認各模塊之間的管路連接正常，確認工作站和儀器連接正常。

紫外可見光檢測器：氘燈和鎢燈使用壽命為2000小時，達到后使用壽命，及時更換氘燈和鎢燈，檢查流通池接頭連接是否緊密。若檢測器內部及外表面濺到液體試劑，及時擦干。 

餾分收集器：將儀器各部分連接好，打開軟件，選擇對應位置，分別發送收集指令，觀察收集管是否在對應的范圍內。

平衡色譜柱，基線穩定后運行分析系統，手動進樣測試。

檢查各模塊連接接頭是否擰緊，確認色譜柱兩端接頭擰緊。

檢查凝膠凈化色譜柱是否濕潤，若發現色譜柱內變干，新配環己烷與乙酸乙酯1:1的流動相，設置流速1mL/min，直到色譜柱內填料濕潤復原。

在色譜系統使用之前，明確以下參數：色譜分析時的所需流動相（為50%環己烷/50%乙酸乙酯）；流動相流速；分析時間；檢測波長點；手動進樣量；收集時間、收集條件，并在軟件界面中對應設置所需參數。

如果使用儲水罐存放純水的話,查看儲水罐中的純水水位是否夠，潔凈度是否達標。

查看下水管道是否通暢。

查看電路上是否存在其他大功率電器防止功率過載。

查看進樣小瓶清洗機內腔是否潔凈無異物，如有污物殘留，可先安裝上空籃架，采用快洗模式，預先清洗一遍。

將切割好的毛細管柱接到進樣口，開通載氣并保持適當流速。

將色譜柱出口端插入盛有甲醇或乙醇的燒杯，正常情況下應能夠觀察有連續的氣泡冒出，否則應及時檢查是否有漏氣、色譜柱斷裂、或進樣口參數異常。

用6倍柱體積（或吹掃約15分鐘）的載氣吹掃色譜柱以排除柱內可能存在的空氣。

設置柱溫箱溫度，起始溫度30℃，保持5分鐘，以5℃/min緩慢升溫至色譜柱溫度上限-20°C后繼續老化2個小時；溫度一般不要超過色譜柱的恒溫溫度上限，柱尾端可以不接檢測器。